می‌شود که شمار اعضای منتخب هیئت اجرایی‌ به کمتر از نصف برسد و بیش از یک سال به پایان زمان قانونی هیئت مذکور باقی باشد.

احکام یادشده در فرض خالی ماندن جایگاه‌ یک عضو هیئت شرعی نیز اعمال می‌شود.

در شرایطی که یاد می‌شود، عضویت اعضای هیئت شرعی‌ و اجرایی پایان می‌یابد:

1. در صورت استعفا و پذیرش آن از سوی هیئت؛

2. در صورت برکناری؛ و این در صورتی است که عضو مرتکب اقدامی شود که به اهداف مجلس ضربه وارد کند و سه‌چهارم‌ اعضای دو هیئت در جلسه‌ای مشترک با برکناری او موافقت‌ کنند.

دفتر مجلس از رئیس و نایب‌رئیس اول و نایب‌رئیس دوم و دبیرکل تشکیل شده است. دفتر مجلس حداقل هفته‌ای یک بار جلسه برگزار می‌کند و وظایف زیر را برعهده‌ دارد:

- کسب اطلاع از گزارش کمیسیون‌های مجلس و مکاتبات و اوراق رسیده و تعیین جدول کاری جلسات هیئت‌های مجلس؛

- رسیدگی به کارهای اداری‌ای‌ که به مقتضای این آیین‌نامه‌ به هیچ مرجع یا شورایی از مراجع و هیئت‌های‌ مجلس مربوط نمی‌شود؛

- اعمال اختیاراتی که هیئت‌های‌ مجلس به آن واگذار می‌کند.

رئیسْ ریاست جلسات هیئت‌های مجلس و دفتر مجلس‌ را برعهده دارد و از طریق دبیرکل، برای تشکیل جلسه از اعضا دعوت می‌کند.

رئیس می‌تواند هرکدام‌ از کمیسیون‌هایی را که در این آیین‌نامه از آن‌ها نام برده شده‌ است، ریاست و برای‌ تشکیل آن اعضا را دعوت کند.

رئیس مجلس‌ عهده‌دار وظایف زیر است:

1. اشراف بر اوضاع و احوال شیعیان و حفظ منافع آنان؛

2. تلاش برای اجرای مصوبات هیئت‌های مجلس؛ وی حق دارد یک بار برای هر مصوبه‌ای با ذکر توجیهات آن‌ در تقاضانامه‌اش تقاضای تجدیدنظر کند؛

3. دخالت برای حل هرگونه اختلافی میان نهادها و انجمن‌های خیریه مربوط به شیعیان؛

4. تعیین متولی اوقاف، چه به‌صورت فردی و چه شورایی، و تعویض آن‌ها براساس پیشنهاد کمیسیون عمومی اوقاف؛

5. تعیین مفتیان جعفری و کارمندان ادارات افتای جعفری و اعضای روحانی مجلس و کارمندان دولتی تصریح‌شده در ماده هفتاد این آیین‌نامه؛

6. پیشنهاد تعیین کارمندان تصریح‌شده در بند اول ماده 53 این آیین‌نامه؛

7. امضای نامه‌ها و بیانیه‌هایی که به نام مجلس صادر می‌شود؛

8. ادای دیگر وظایف و اختیاراتی که به موجب قانون و احکام این‌آیین‌نامه و یا به موجب‌ تعهد هیئت‌های مجلس به او واگذار می‌شود.